1、温度不适
（1）一般情况下，种子的成熟度越高，发芽率越高，完整的种子需要25天才可以成熟。
（2）水稻种子萌发的低温为10-15°C，适宜的温度为30-35°C。因为同一植物上的种子在植物上具有不同的开花部分，完全成熟的种子是浅的并且易于发芽。
（3）未完全成熟的种子不可非常好地休眠，并且往往会发芽晚。
2、种子收获过早或过晚
（1）水稻种子的休眠期不明显。收获前种子尚未完全成熟，如果没有干燥，仍然需要呼吸作用。消耗营养营养素，使发芽率降低。
（2）种子收获太晚了，在田间高温高湿的情况下，容易引起种子萌动生芽，导致发芽率降低。
（3）另一方面，种子水分高，种子老化加速，发芽率降低。
3、种子翻晒不及时
（1）种子单位数量非常大，因为场地的限制，以及缺乏必要的干燥设备，种子在收获后不可及时储存，种子的含水量一般较高，导致谷堆闷种发蒸，而且谷壳是黑色和发霉的。
（2）另外，水泥质地晒场在高温下不会及时翻动，这将严重影响种子的发芽率。
4、机械损坏
（1）一些品种的种子非常薄或在它们饱满后会有破裂的种子。在收获和选择性加工过程中，这些品种很容易脱壳成糙米。
（2）因为保护层的去除，这些糙米一般难以发芽，即使可以发芽也难以形成幼苗，在稻田容易腐烂。
（3）另外，如果病虫害严重，控制措施不及时，功能叶片或运输通道受损，相应的功能减少或丧失，这将导致种子胚胎发育功能缺乏，即使它能发芽，它也非常脆弱，很难成为幼苗。
1、播前晒种
（1）浸种催芽前将种子翻晒1至2天，可以增强种皮的透性，增进酶的活性，有提高发芽率和发芽势的作用。这对部分农民习惯于在早春购种，种子在购回后因贮藏保管不善而易吸湿的情况下尤其重要
（2）另外，晒种或浸种还可降低种子内的发芽抑制物质如谷壳内脂A、谷壳内脂B、离层酸和香草酸等的浓度，因而有促进提早发芽的作用。又因晒种能使种子干燥一致，种子间含水量的差异，故浸种后吸水均匀，催芽时发芽整齐。
（3）同时，因为太阳光谱中的短波如紫外线具有能力，因而晒种也能起到一定的作用。
2、药剂浸种
（1）浸种的目的，主要是满足稻种发芽对水分的要求，使全部种子均匀地吸足水分，催芽时发芽迅速而整齐。
（2）水稻种子浸种的时间：当浸种温度为11—12摄氏度是，可浸种5-7天。
（3）水稻的某些病害是通过种子传染的。如稻瘟病、恶苗病、白叶枯病、胡麻叶斑病、干尖线虫病等。采用药剂浸种可以起到良好的防治效果。
（4）而一些病害如恶苗病、干尖线虫病，采用药剂浸种是一种有效的防治方式。常用的浸种药剂有咪鲜胺、氰烯菌酯等。
3、保湿催芽
（1）保湿保温是水稻种子浸种催芽主要的技术环节，也是农民朋友在种子浸种催芽过程中容易出现问题的环节。
（2）种子在经过规定时间的浸种后，通常认为其种子吸取的水份已足够种子正常发芽所需的水分。
（3）种子在浸种后把种子沥干，用保湿性较好的塑料袋扎好，在气温较低时，种子袋用少许的覆盖物盖好保温。
（4）在催芽过程中注意经常检查种子温度，避免因温度过高而烧芽。忌加冷水或温水。
4、摊晾晒芽
（1）种子在催芽后，为了增强谷芽播种后对自然低温环境的适应能力，催芽后还应摊晾炼芽。通常在谷芽催好后，置室内摊放晾芽一定时间（半天以上），再行播种。
（2）有时谷芽催好后，因寒潮侵袭或其他原因不可及时播种时，也可用摊放晾芽方式，降温降湿，控制根芽生长，在有利的天气再进行落谷播种。
