1、青蛙蝌蚪体色较浅，多为青灰色，身体略微呈圆形，尾巴较长，口长在头部前端，而蟾蜍蝌蚪体色呈黑色，身体略微呈椭圆形，尾巴较短，口长在头部前端腹面。
2、青蛙蝌蚪一般为单独行动或小队行动，散落于池塘或沟渠、水田中，且游动没有任何规律，而蟾蜍蝌蚪喜欢成群活动，一般密集成群，且成群后往往回朝着同一方向游动。
3、蟾蜍蝌蚪游动速度较慢，容易捕捉，而青蛙蝌蚪游泳速度较快，较为灵活，捕捉难度相对较大。
4、用放大镜观察蝌蚪头部前端，其角质细齿排列方式不同，虽然二者下唇的下方都长有3排角质细齿，但青蛙蝌蚪的上排齿中断，而蟾蜍蝌蚪的3排细齿都不断开。
5、蟾蜍蝌蚪的个头相较于青蛙蝌蚪的个头要小。
6、蟾蜍产卵时间比青蛙产卵时间要更早，如果是清明前后大量出现的蝌蚪，一般为蟾蜍蝌蚪，而青蛙蝌蚪一般要等到初夏时节才能观察到。
蟾蜍卵由胶质膜围成一条条的约一指宽的线状长带，而卵则在带内呈带状单行排列，尤为整齐，称之为卵带。而青蛙卵成片、成团出现，排列的比较杂乱，不规则。
