骡子是公驴和母马杂交而来的，两者存在生殖隔离，不能繁殖后代。主要原因是骡子染色体不成对，生殖细胞不能正常分裂，几乎不能繁殖后代。
1、无论是马骡还是驴骡，染色体的数量都不太正常。这是因为驴的2号染色体与马的1号染色体同源，驴13与马11，驴14与马13。驴16与驴25加起来对应马5，并且马具有32对染色体，而驴则是31对。虽然马和驴的亲缘关系比较近，其配子不仅可以彼此结合，而且还可以发育成完整的个体，但是其子代细胞中的染色体数目成了32+31，无论怎么样总有一条染色体是孤单的。
2、同时，骡子依然是幸运的。因为如果这是某匹马细胞中的染色体数目的话（如果是马则称为单体2n-1），那它基本上不能生存，对于有性生殖的二倍体物种来说，纯粹的单倍体的生存能力都比这种状态的好。反之，这如果是一头驴细胞中的染色体构成则成为三体，多余的那条染色体一定有三条。32+31的骡子，并不是真正的31对+1的关系。也就是说在减数分裂的时候，它不会简单的将31对染色体彼此分离，然后多余的那条再随机分配。这就是骡子乃至别的杂交动物遇上的麻烦，它们的染色体在分离的过程中，趋向于随机分离自由组合。因为对于能够存活的三体来说，其可育性虽然比正常的低，但也是相当高的，除了那条多余的染色体之外，其余的都能正常配对，彼此分离。
3、对于不幸的骡子（以母骡为例）而言，要生成一个正常的卵子的机会是多少，比如说一个极端的情况，其卵子中恰好含有31条来自驴的染色体，或者32条来自马的染色体。显然这样的概率是相当之低的，当然实际情况不需这样极端，毕竟骡子本身是可以生存的，也就是说在卵子中可以是马和驴的染色体的融洽组合。
